J'ai eu un autre accès de parano, ce qui m'a poussé à chiffrer l'intégralité (sauf /boot) du disque de mon eeePC grâce à LUKS.
Un accès physique est donc totalement inutile si on veut pirater mon PC.
Pour chiffrer toutes mes données, j'ai suivi cet excellent tutoriel :
https://help.ubuntu.com/community/EncryptedFilesystemLVMHowto
C'est très détaillé et très bien expliqué.

Le temps de boot est à peine rallongé